Pro práci s PDF dokumenty lze samozřejmě použít i nástroje (programy) přímo od společnosti Adobe, která formát PDF vyvinula. Z celé plejády těchto nástrojů se podrobněji zastavíme u dvou různých produktů, které reprezentují dva odlišné přístupy k podepisování: u programu Adobe Acrobat, který je placeným (komerčním) programem a u Adobe Readeru, který je k dispozici zdarma. Přesto i on nabízí určité možnosti podepisování elektronických dokumentů ve formátu PDF.
Nejvíce možností pro vytváření elektronických podpisů pochopitelně poskytuje „vlajková loď“ Adobe pro PDF dokumenty, kterou je program Adobe Acrobat. Ten umožňuje vytvářet a přidávat k PDF dokumentům snad všechny možné varianty interních elektronických podpisů – certifikační podpisy i podpisy „běžné“, podpisy viditelné i neviditelné, s časovými razítky i bez nich. Stejně tak umožňuje přidávat více podpisů na jeden a tentýž dokument.
Adobe Acrobat navíc dokáže „připravit“ PDF dokument (tzv. odemknout ho, resp. aktivovat) tak, aby mohl být následně podepsán ve volně šiřitelném programu Adobe Reader.
Co ale Adobe Acrobat neumí, je vytvářet externí podpisy. Specializuje se jen na podpisy interní.